O respeito pelo bem-estar dos animais e seu estado sanitário é uma das grandes preocupações desta Instituição. A Guarda Nacional Republicana criou em 2001 o Serviço de Proteção da Natureza e do Ambiente (SEPNA) mais tarde, juridicamente reconhecido com a publicação do Decreto Lei 22/2006 e pela Portaria 798/2006, entre outros diplomas. O SEPNA, dispõe de um serviço totalmente vocacionado para as áreas de intervenção no âmbito da conservação e proteção da natureza e do meio ambiente, património natural e histórico, dos recursos hídricos, dos solos e da riqueza cinegética, piscícola, florestal ou outras, previstas na legislação ambiental e também nas áreas do bem-estar animal e seu estado sanitário
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